조직 : 국토안전관리원 조직은 본사 와 소속기관으로 한다. 소속기관은 권역별 소관업무를 담당하는 지역본부와 본사의 업무를 지원하는 부속기관으로 구분한다.
본사 : 원장을 보좌하기 위한 직속기구로 혁신성과실, 홍보실, 비서실을 둔다.
부원장 관할하에 상생협력실을 둔다.
본사에는 감사실, 재난안전본부, 경영본부, 건설안전본부, 기반시설본부, 건축시설본부를 둔다.
재난안전본부 하위에 재난안전관리실, 안전보건관리실, 공공기관안전평가실, 사고정보분석실1)을 둔다.
경영본부 하위에 기획조정실, 인사노무실, 운영지원실, 디지털기획운영실을 둔다.
건설안전본부 하위에 건설안전관리실, 건설품질관리실, 건설안전평가실, 지하안전관리실, 건축분쟁전문위원회사무국을 둔다.
기반시설본부 하위에 기반시설관리실, 시설성능관리실, 시설안전평가실, 특수시설관리실을 둔다.
건축시설본부 하위에 건축시설관리실, 건축시설안전실, 건축시설성능실, 내진성능관리실, 하자심사분쟁조정위원회사무국을 둔다.
소속기관 : 국토안전관리원의 권역별 업무를 수행하기 위해 수도권지역본부, 충청지역본부, 강원지역본부, 영남지역본부, 호남지역본부를 둔다.
국토안전원 본사의 업무를 지원하기 위해 부속기관으로 안전성능연구소와 국토안전교육원을 둔다.
각 지역본부의 소재지 및 관할 구역은 시행규칙에서 정하는 바에 따른다.
안전성능연구소 하위에 정책연구실, 기술개발실을 둔다.
국토안전교육원 하위에 인재교육실을 둔다.
수도권지역본부 하위에 사업지원실, 건설안전1실, 건설안전2실을 둔다.
충청지역본부 하위에 사업지원실, 건설안전실, 기반시설안전실, 건축시설점검실을 둔다.
강원지역본부 하위에 사업지원실, 건설안전실, 기반시설안전실을 둔다.
영남지역본부 하위에 사업지원실, 건설안전실, 기반시설안전실을 둔다.
호남지역본부 하위에 사업지원실, 건설안전실, 특수교관리실을 둔다.
1)사고정보분석실에 건설사고조사위원회사무국, 중앙지하사고조사위원회사무국, 중앙시설물사고조사위원회사무국, 중앙건축물사고조사 위원회를 둔다.
